Если проблема только с ярлыками -- значит, файлы типа "ярлык" (с расширением .lnk, которое не показывается даже если опция показа расширений включена) были вручную сопоставлены с Вордом (по умолчанию они должны обрабатываться самой системой). Ну т.е. папа правокликнул файл-ярлык и выбрал "открыть вордом" при установленной галочке "всегда использовать для всех таких файлов".

Если бы дело было в вин.ХП, то в любом окне файлового менеджера есть пункт меню "свойства папки", и в ней раздел "типы файлов", там перечислены все известные системе расширения и кого кем открывать. Там этот .lnk и отлавливается. Под вин7 могли и переделать, но вдруг оставили?